পার্টিশন সেক্টর হলো হার্ডডিস্কের প্রথম সেক্টর। এটি ডিস্ক সম্পর্কিত তথ্য ধারণ করে। যেমন, প্রত্যেকটি পার্টিশনের সেক্টর নাম্বার। এখানে ডস পার্টিশন এবং ছোট প্রোগ্রাম শুরু হয়। কমপিউটার চালু হয়ে পার্টিশন সেক্টর রিড করে এবং কোর্ড নির্বাহ করে। ভাইরাসসমূহ যেগুলো পার্টিশন ব্যবহার করে সেগুলো এ কোর্ড মডিফাই করে। ফ্লপি ডিস্কের কোন পার্টিশন সেক্টর নেই।